مخطوطات الكتاب لكتاب أخلاق أهل القرآن أربع نسخ في المكتبة الظاهرية بدمشق . ونسختان إحداهما في برلين والأخرى في دار الكتب المصرية . أما عن مخطوطات الظاهرية : النسخة الأولى : تنقص منها الورقة الأولى ، وورقات من آخرها وهي في مجموع ٦٦ (ق ١٣٧ - ١٤٤ ) . النسخة الثانية : وينقص منها أيضاً ورقات في أولها وهي في مجموع ٤٠ ق ٧٤ - ٩١) . النسخة الثالثة : وهي نسخة جيدة كاملة في مجموع ٤١ (ق ١٦٢ - ١ - ٧٢ - ١) . النسخة الرابعة : يوجد قطعة منها بخط الحافظ عبد الغني المقدسي في مجموع ٨٥ ق ٢٧٤ - ٢٨٢ . ۲۳